【RNAseq 3小學堂】RNAseq多的是,你不知道的事 | 化學工廠資訊網
![【RNAseq 3小學堂】RNAseq多的是,你不知道的事](https://i.imgur.com/lO00bdM.jpg)
2021年12月31日—NGS定序成本的降低使得RNAseq的成本也在持續下降,在相同的經費下可以進行更多樣本的定序,而且目前學術研究也有越來越要求RNAseq進行有生物性重複 ...
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#RNAseq #實驗設計 #雲平台 #3小學堂
|| 3分鐘速解RNAseq分析,本周RNAseq多的是,你不知道的事 ||
看完了一系列的 RNAseq 3小學堂,相信你對 RNAseq 分析結果和報告內容有了進一步的認識,你是不是躍躍欲試了呢!小編在這裡整理了幾個在過去的經驗中,一些可能會被忽略的部分,強烈建議在開始實驗之前先瀏覽本篇文章喔~
|| 條件允許的話,做生物性重複吧! ||
NGS 定序成本的降低使得 RNAseq 的成本也在持續下降,在相同的經費下可以進行更多樣本的定序,而且目前學術研究也有越來越要求 RNAseq 進行有生物性重複的趨勢,如果經費和樣本取得沒有太大困難的話,會非常建議做 3 以上的生物學重複。
1. 生物學重複的意義在於對生物學上的不同樣本做相同的處理,減少個體差異帶來的影響,除了樣本的差異之外其餘條件應維持相同。
2. 一般而言,有生物學重複會分析結果是比較可信的,在不同次實驗間的重複性也會較好,可以得到較穩定的分析結果。
3. 在樣本間相關性分析中有提到,生物性重複不僅可以觀察整體實驗的穩定度,有必要的話可以考慮剔除離群值。[1] 4. 無生物學重複的實驗也可以進行分析,使用的分析方法不同,如果樣本珍貴或是臨床樣本依然還是可以進行 RNAseq 分析的,但 DEGseq 在無重複樣品的統計上是以資料分佈估算推論各基因潛在的變異程度,對於單一處理基因表現...Eukaryotic RNA | 化學工廠資訊網
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